San Pedro Sula è anche tra le città che sono state danneggiate. La produzione di banane si è completamente fermata in città per questo motivo. Ciò causa anche un aumento dei tassi di criminalità nella città. Con un clima di savana tropicale, la città riceve frequentemente pioggia durante tutto l'anno e i valori di temperatura sono elevati. A volte possono verificarsi tornado e uragani.